JSECは、世界75以上の国や地域から高校生が集まり科学技術を競うコンテスト「Intel ISEF(Intel International Science and Engineering Fair、インテルアイセフ)」における日本の提携フェアに位置づけられており、上位入賞者は2018年5月に米国で開催されるIntel ISEFに派遣される。また、東京大学、大阪大学、千葉大学、神奈川工科大学、東京理科大学、慶應義塾大学、早稲田大学、立命館大学が実施するAO入試および推薦・特別選抜入試の対象コンテストにもなっている。